「臺灣近代醫療文物資料庫」是由國立臺灣大學醫學院圖書分館及臺大醫院秘書室執行建置，內容涵蓋醫學校區所典藏珍貴醫療文物、舊籍、期刊，以及具歷史意義之老照片，經整理、數位化、metadata建檔後，提供讀者查詢檢索數位影像與詮釋資料，期協助民眾瞭解二次世界大戰前後的臺灣醫療歷史，並達到「將國家重要的文物典藏數位化，保存我國醫療發展史之紀錄」、「促進醫療人文、學術和教育之研究發展」、「完整呈現臺灣文化與社會之多樣性」目的。

依藏品類型本資料庫分為四個子資料庫：

一、文物：為醫學院及醫院各臨床學科單位所典藏自日治時期保存至今之珍貴醫療器具與器械。

二、舊籍：為日治時期以來醫學校區中重要而特殊之醫學舊籍、醫院舊檔案等相關資料。

三、期刊：為醫學校區中所典藏自日治時期至今出版之醫學期刊論文。

四、照片：為包含醫學校區與醫院所蒐集，日治時期以來與建築、醫療、人物等相關之老照片。少部份因涉及病友及家屬隱私，故臉部會以馬賽克處理。

目前資料庫共收錄超過4,000筆資料，提供整合檢索、權威查詢、一般查詢、同音查詢等查詢模式，便利使用者快速檢索所需資料。部分全文影像限於臺灣大學網域內瀏覽。